仕事内容

人獣共通感染症ウイルスのバイオインフォマティクス解析

1. 配列からウイルスの形質を予測・解釈する機械学習モデルの構築

   ウイルスの遺伝子配列のみからヒトへの感染リスクを評価する機械学習モデルの構築に取り組んでいます。

   関連：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.25.591033v1

2. 公共データベース利活用によるウイルスゲノム配列の大規模探索

   データベースに蓄積しているハイスループットシークエンスデータからウイルスゲノム配列を探索することで、新種ウイルスの発見やウイルス蔓延状況を調査しています。

   関連：https://journals.asm.org/doi/10.1128/mbio.01638-21

3. 系統ダイナミクス法によるウイルス感染ダイナミクスの復元

   データベースに蓄積してきたウイルス配列を系統ダイナミクス法によって解析することで、いつ・どの程度の規模で動物でのウイルス感染が蔓延していたのかを推定しようと試みています。

4. タンパク質構造情報を活用したウイルス多様性の解明

   2.に関連して、保存性の高い構造情報を活用した未知ウイルスを探索法の開発に取り組んでいます。

5. その他

   上記の研究に合致しない場合でも、受け入れが可能である場合があります。まずは問い合わせをお待ちしております。

職種

学生・ポスドク・研究員：どなたでもOKです。

勤務地住所

下記のいずれか：

国立感染症研究所 戸山庁舎（https://www.niid.go.jp/niid/ja/accessmap.html）

千葉大学亥鼻キャンパス（https://www.m.chiba-u.ac.jp/about/access/）

リモートワークも可能です、一度ご相談させていただければと思います。

募集人数

2-3名